Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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H2-ObO35424 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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H2-ObO35424 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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H2-ObO35424 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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H2-ObO35424 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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H2-ObO35424 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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H2-ObO35424 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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H2-ObO35424 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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