Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Scarb2O35114 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Scarb2O35114 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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