Protein–RNA interactions for Protein: O09174

Amacr, Alpha-methylacyl-CoA racemase, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmacrO09174 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmacrO09174 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmacrO09174 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmacrO09174 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmacrO09174 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmacrO09174 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmacrO09174 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmacrO09174 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmacrO09174 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmacrO09174 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmacrO09174 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmacrO09174 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmacrO09174 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmacrO09174 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmacrO09174 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmacrO09174 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmacrO09174 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmacrO09174 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmacrO09174 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmacrO09174 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmacrO09174 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmacrO09174 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmacrO09174 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
AmacrO09174 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmacrO09174 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmacrO09174 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmacrO09174 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmacrO09174 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmacrO09174 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmacrO09174 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmacrO09174 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
AmacrO09174 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmacrO09174 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmacrO09174 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmacrO09174 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmacrO09174 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmacrO09174 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmacrO09174 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
AmacrO09174 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmacrO09174 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmacrO09174 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmacrO09174 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmacrO09174 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AmacrO09174 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AmacrO09174 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms