Protein–RNA interactions for Protein: L7N2A2

Gm8906, Predicted gene 8906 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8906L7N2A2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8906L7N2A2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8906L7N2A2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8906L7N2A2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8906L7N2A2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8906L7N2A2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8906L7N2A2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8906L7N2A2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8906L7N2A2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8906L7N2A2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8906L7N2A2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8906L7N2A2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8906L7N2A2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8906L7N2A2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8906L7N2A2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8906L7N2A2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8906L7N2A2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8906L7N2A2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8906L7N2A2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8906L7N2A2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8906L7N2A2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8906L7N2A2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8906L7N2A2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8906L7N2A2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8906L7N2A2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8906L7N2A2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8906L7N2A2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8906L7N2A2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8906L7N2A2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8906L7N2A2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8906L7N2A2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8906L7N2A2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8906L7N2A2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8906L7N2A2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8906L7N2A2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8906L7N2A2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8906L7N2A2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm8906L7N2A2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm8906L7N2A2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm8906L7N2A2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm8906L7N2A2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm8906L7N2A2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm8906L7N2A2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm8906L7N2A2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8906L7N2A2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms