Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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