Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms