Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nccrp1G3X9C2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms