Protein–RNA interactions for Protein: E9PXM3

Vmn1r177, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r177E9PXM3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms