Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms