Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4S3

Ptrhd1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptrhd1D3Z4S3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms