Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms