Protein–RNA interactions for Protein: B8QI36

Ppfia4, Liprin-alpha 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia4B8QI36 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia4B8QI36 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms