Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rd3lB2RV38 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms