Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms