Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H60cB1B213 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H60cB1B213 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H60cB1B213 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H60cB1B213 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H60cB1B213 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms