Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp4A4UUI3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp4A4UUI3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp4A4UUI3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp4A4UUI3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp4A4UUI3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp4A4UUI3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp4A4UUI3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp4A4UUI3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp4A4UUI3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp4A4UUI3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp4A4UUI3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp4A4UUI3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp4A4UUI3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp4A4UUI3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp4A4UUI3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp4A4UUI3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp4A4UUI3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp4A4UUI3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp4A4UUI3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp4A4UUI3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp4A4UUI3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp4A4UUI3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp4A4UUI3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp4A4UUI3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp4A4UUI3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp4A4UUI3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp4A4UUI3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms