Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rbbp8nlA2ABX0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp8nlA2ABX0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms