Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms