Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms