Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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RTL8BQ17RB0 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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