Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
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RPE65Q16518 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
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RPE65Q16518 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
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RPE65Q16518 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
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