Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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IFT88Q13099 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IFT88Q13099 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
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