Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF56Q15929 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms