Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
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VPS72Q15906 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
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