Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.1 ms