Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPREP23469 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPREP23469 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPREP23469 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPREP23469 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPREP23469 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPREP23469 ZNF585B-203ENST00000527838 2732 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPREP23469 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPREP23469 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPREP23469 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPREP23469 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPREP23469 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPREP23469 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPREP23469 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPREP23469 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPREP23469 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPREP23469 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPREP23469 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPREP23469 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPREP23469 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPREP23469 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPREP23469 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPREP23469 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPREP23469 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPREP23469 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPREP23469 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPREP23469 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPREP23469 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPREP23469 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPREP23469 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPREP23469 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPREP23469 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPREP23469 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPREP23469 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPREP23469 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPREP23469 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPREP23469 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPREP23469 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPREP23469 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPREP23469 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPREP23469 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPREP23469 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPREP23469 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPREP23469 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPREP23469 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPREP23469 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPREP23469 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPREP23469 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPREP23469 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
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PTPREP23469 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPREP23469 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPREP23469 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
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PTPREP23469 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPREP23469 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPREP23469 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPREP23469 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPREP23469 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPREP23469 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPREP23469 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPREP23469 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPREP23469 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPREP23469 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPREP23469 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPREP23469 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPREP23469 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPREP23469 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPREP23469 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPREP23469 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPREP23469 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPREP23469 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPREP23469 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPREP23469 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
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