Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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