Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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RFXAPO00287 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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RFXAPO00287 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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RFXAPO00287 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
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RFXAPO00287 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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RFXAPO00287 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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RFXAPO00287 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
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RFXAPO00287 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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RFXAPO00287 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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