Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms