Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BBS9Q3SYG4 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.3 ms