Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 CHCHD7-205ENST00000517933 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC117382.1-201ENST00000468074 730 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 RN7SL571P-201ENST00000468302 295 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Q1T7F1 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
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