Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
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