Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SHHQ15465 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SHHQ15465 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SHHQ15465 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SHHQ15465 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SHHQ15465 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SHHQ15465 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SHHQ15465 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SHHQ15465 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SHHQ15465 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SHHQ15465 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SHHQ15465 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SHHQ15465 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SHHQ15465 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SHHQ15465 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SHHQ15465 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SHHQ15465 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SHHQ15465 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
SHHQ15465 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
SHHQ15465 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
SHHQ15465 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
SHHQ15465 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
SHHQ15465 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SHHQ15465 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SHHQ15465 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SHHQ15465 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SHHQ15465 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SHHQ15465 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SHHQ15465 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SHHQ15465 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SHHQ15465 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SHHQ15465 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SHHQ15465 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SHHQ15465 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SHHQ15465 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SHHQ15465 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SHHQ15465 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SHHQ15465 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SHHQ15465 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SHHQ15465 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SHHQ15465 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SHHQ15465 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SHHQ15465 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SHHQ15465 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SHHQ15465 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SHHQ15465 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SHHQ15465 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SHHQ15465 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SHHQ15465 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SHHQ15465 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SHHQ15465 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHHQ15465 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHHQ15465 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHHQ15465 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHHQ15465 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHHQ15465 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHHQ15465 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHHQ15465 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHHQ15465 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHHQ15465 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHHQ15465 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHHQ15465 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHHQ15465 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHHQ15465 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHHQ15465 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHHQ15465 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHHQ15465 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHHQ15465 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHHQ15465 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHHQ15465 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHHQ15465 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHHQ15465 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHHQ15465 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHHQ15465 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHHQ15465 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHHQ15465 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHHQ15465 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHHQ15465 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHHQ15465 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHHQ15465 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SHHQ15465 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SHHQ15465 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SHHQ15465 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SHHQ15465 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SHHQ15465 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SHHQ15465 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
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