Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CACNA1SQ13698 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CACNA1SQ13698 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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