Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTLA4P16410 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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