Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.53
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