Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 SETP4-201ENST00000455717 868 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC138627.1-204ENST00000641894 765 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC1.66□□□□□ -2.14
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