Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
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