Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms