Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
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