Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
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