Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms