Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms