Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms