Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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CCDC142Q17RM4 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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CCDC142Q17RM4 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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CCDC142Q17RM4 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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CCDC142Q17RM4 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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CCDC142Q17RM4 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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