Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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