Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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SIX1Q15475 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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SIX1Q15475 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
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SIX1Q15475 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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