Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SHHQ15465 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SHHQ15465 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.85
SHHQ15465 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
SHHQ15465 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
SHHQ15465 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SHHQ15465 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SHHQ15465 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SHHQ15465 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SHHQ15465 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SHHQ15465 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SHHQ15465 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SHHQ15465 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SHHQ15465 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SHHQ15465 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SHHQ15465 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SHHQ15465 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SHHQ15465 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SHHQ15465 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SHHQ15465 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SHHQ15465 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SHHQ15465 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SHHQ15465 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SHHQ15465 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SHHQ15465 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SHHQ15465 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SHHQ15465 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SHHQ15465 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SHHQ15465 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SHHQ15465 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SHHQ15465 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SHHQ15465 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SHHQ15465 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SHHQ15465 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SHHQ15465 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SHHQ15465 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SHHQ15465 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SHHQ15465 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SHHQ15465 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SHHQ15465 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SHHQ15465 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SHHQ15465 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SHHQ15465 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SHHQ15465 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SHHQ15465 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SHHQ15465 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SHHQ15465 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SHHQ15465 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SHHQ15465 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SHHQ15465 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SHHQ15465 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SHHQ15465 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SHHQ15465 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SHHQ15465 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SHHQ15465 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
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