Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms