Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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DDX39BQ13838 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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DDX39BQ13838 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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